补充协议为准。补充协议并未改变主合同的主要目的，也就是买房卖房这个主合同目的未改变，只是在一些细节上的修改和补充，未经备案并不影响其法律效力，而且，补充协议是对主合同的修改和完善，即使是同时签署的，也会以补充协议上的内容为准的。

购房补充协议要注意什么

1、明确协议内容与关键细节：‌补充协议应针对主合同中未约定或模糊的条款进行细化，例如‌房屋交付标准‌(包括装修材料品牌、规格)、配套设施、公摊面积处理、产权办理期限等，并确保表述具体清晰，避免使用“高档”等模糊用语，必要时可将主合同作为附件或引用其条款。‌

2、‌审查违约责任与争议解决机制：‌需详细约定双方违约情形及赔偿方式，如逾期交房、逾期付款的违约金计算标准或退款责任;同时明确争议解决方式(如诉讼或仲裁地点)，并注意补充协议中的违约条款不得排除己方主要权利或加重己方责任。‌

3、确认协议效力与主体一致性：‌补充协议的签订主体应与主合同一致，且需明确其与主合同具有同等法律效力;协议内容不得与主合同核心条款或法律法规强制性规定相冲突，否则可能导致部分条款无效。‌

4、核实房屋产权与交易条件：‌签署前应确认房屋产权清晰，无抵押、查封等限制交易情形，并在协议中约定解决方式及责任主体;若涉及广告承诺或赠送面积，需将其具体细节(如位置、使用年限)写入协议并明确违约责任。‌

5、审慎对待格式条款与签字程序：‌对于开发商提供的格式条款，应仔细审查是否公平合理，是否存在排除己方权利的条款;签字盖章前需再次核对全文，确保内容无误后再签署，以避免后续纠纷。‌