小产权房不可以办理合同备案。因为小产权房多建在农村集体土地上，既未缴纳土地出让金等相关费用，也没有国家发放的国有建设用地使用权证和预售许可证。而合同备案的前提是房屋具备合法合规的产权相关手续，能纳入国家房管部门的正规监管，小产权房显然不符合这些条件，其购房合同在国土房管局不会被给予备案。并且相关政策还明确小产权房不得登记发证，这也从根本上杜绝了其办理合同备案的可能性。

小产权房租赁合同纠纷应该如何处理

1、优先双方协商，就租金退还、损失赔偿、合同解除等争议点沟通，达成一致后签订书面和解协议，同时留存好租金支付凭证等相关凭证。

2、协商无果可向房屋所在地的村委会、居委会或人民调解委员会申请调解，由第三方居中说服疏导，促使双方自愿达成调解方案。

3、若双方事前签订仲裁协议或事后达成仲裁约定，可将纠纷提交仲裁机构，凭借其作出的终局裁决解决纠纷，该方式流程简洁且能避免长期诉讼的困扰。

4、无仲裁约定或调解无效时，可向房屋所在地基层法院起诉，起诉前准备好租赁合同、沟通记录等证据，诉讼中法院会先明确合同效力，再按双方过错划分责任，比如违建导致合同无效的，会判定过错方承担对应损失赔偿。

5、若纠纷因房屋被认定为违建强拆引发，可先向当地土地、规划部门反映情况协调处理，若对行政部门的处理结果不满，可进一步提起行政复议。

6、若房东存在隐瞒小产权房性质欺诈租客、多重租赁等情况，租客除主张民事赔偿外，若房东涉嫌**，还可向公安机关报案。