在处理专用发票抵扣时，需遵循以下关键步骤：

1. 首先，获取专用增值税发票，并在发票认证系统上完成认证流程。

2. 接着进行入账处理。

3. 进行进货处理，具体会计分录如下：

借：库存商品

应交税费—应交增值税（进项）

贷：银行存款

4. 然后是销售处理，相应的会计分录为：

借：银行存款

贷：主营业务收入

应交税费—应交增值税（销项）

5. 如果当期的进项加留底税额大于销项税额，则直接进行抵扣，无需进行额外的账务处理。若销项税额超过了进项加留底的总额，那么可以抵扣全部进项和留底，对于未完全抵扣的销项税额，需要进行转出处理，具体会计分录为：

借：应交税费—应交增值税（转出未交增值税）

贷：应交税费—未交增值税

6. 最后，缴纳增值税，相关会计分录如下：

借：应交税费—未交增值税

贷：银行存款