子公司在申报企业所得税时，其流程主要取决于是否拥有法人资格。

1、对于不具备法人资格的子公司，即作为总公司下属的营业机构，其年度所得税的汇算清缴工作应由总公司负责完成，并向当地主管税务机关报送相关材料。

2、如果子公司具备独立核算的法人资格，那么它需要自行向当地主管税务机关报送所得税申报表。若该子公司没有应纳税所得额或企业所得税额为零，只需据实进行申报即可。