在处理农产品加计扣除1%的计算时，我们需考虑纳税人购进用于生产或委托加工13%税率货物的农产品。按照现行政策，这类农产品的进项税额可按10%的扣除率进行计算，并在此基础上给予1%的加计扣除优惠。这一优惠政策旨在鼓励对农产品进行深加工，促进农业产业链的延伸和升级。

会计分录方面，当企业发生上述交易时，应借记“生产成本—基本生产成本（直接材料）”科目，以反映农产品作为直接材料的投入成本；同时，借记“应交税费—应交增值税（进项税额）”科目，以记录按扣除率计算的进项税额；最后，贷记“原材料”科目，完成账务处理。

通过这样的会计处理，企业不仅能够准确核算农产品的成本和进项税额，还能享受到国家对农业深加工的税收优惠政策，进一步优化企业的税务结构和经营效益。