在年末资产负债表中，应付职工薪酬的余额并不一定为零。

如果单位已经全额支付了计提的工资，并且不存在欠员工工资的情况，那么资产负债表中的应付职工薪酬余额将会是零。

然而，如果有部分计提的工资尚未支付，那么资产负债表中的应付职工薪酬余额就不会是零。