在税务处理中，差额征收和全额交税的发票开具方式存在差异。具体来说：

（1）对于一般纳税人，

1. 若选择简易计税方法进行差额征税，有两种方式：

方式一：通过增值税发票管理新系统中的正常开票功能，以取得的全部价款和价外费用为基础，扣除代用工单位支付给劳务派遣员工的工资、福利以及为其办理的社会保险及住房公积金后的余额，按照5%的征收率开具增值税专用发票；而代用工单位支付给劳务派遣员工的工资、福利及为其办理的社会保险及住房公积金则按照5%的征收率开具增值税普通发票。

方式二：同样利用增值税发票管理新系统中的正常开票功能，直接以取得的全部价款和价外费用总额，按照5%的征收率开具增值税普通发票。

2. 若选择一般计税方法，则通过增值税发票管理新系统中的正常开票功能，以取得的全部价款和价外费用总额，按照6%的税率全额开具增值税发票。

（2）对于小规模纳税人，1. 若选择简易计税方法进行差额征税，也有两种方式：

方式一：通过增值税发票管理新系统中的正常开票功能，以取得的全部价款和价外费用总额，按照5%的征收率全额开具增值税普通发票。

方式二：同样利用增值税发票管理新系统中的正常开票功能，以取得的全部价款和价外费用总额为基础，扣除代用工单位支付给劳务派遣员工的工资、福利以及为其办理的社会保险及住房公积金后的余额，按照5%的征收率到国税机关申请代开增值税专用发票；而代用工单位支付给劳务派遣员工的工资、福利及为其办理的社会保险及住房公积金则按照5%的征收率开具增值税普通发票。

2. 若选择简易计税方法，则有两种方式：

方式一：通过增值税发票管理新系统中的正常开票功能，以取得的全部价款和价外费用总额，按照3%的征收率全额开具增值税普通发票。

方式二：同样利用增值税发票管理新系统中的正常开票功能，以取得的全部价款和价外费用总额，按照3%的征收率到国税机关申请代开增值税专用发票。