当甲方代扣代缴水电费时，这种情况通常发生在乙方为甲方提供装修服务等工程项目中。对于乙方而言，这笔费用应当被计入其成本核算之中。具体的会计分录如下：
- 借方：工程施工—合同成本—其他直接费用 - 应交税费—应交增值税—进项税额 - 贷方：其他应付款—甲方
这样处理不仅符合财务规范，也确保了双方权益的明确划分。