对于一般纳税人单位而言，当他们收到自产自销农产品的免税发票时，其入账成本的计算方法是：购买价款减去可以抵扣的进项税额。

具体来说，可以抵扣的进项税额等于购买价款的9%。

当一般纳税人单位取得自产自销农产品的免税发票时，其账务处理方式如下：

借方记录原材料科目，

同时在应交税费—应交增值税（进项税额）科目中记录可以抵扣的金额，

贷方则记录银行存款等相应科目。