支付软件著作权申请费的会计处理方式如下：
首先，当支付软件著作权申请费时，会计分录为：借：预付账款；贷：银行存款。这意味着公司将一笔资金记入预付账款，表示已支付软件著作权申请费，同时减少银行存款。
其次，当取得专利费发票时，会计分录为：借：无形资产；借：应交税费-应交增值税-进项税额；贷：预付账款。这表明公司将专利费记入无形资产，同时记录应付的增值税，并减少预付账款。
无形资产是指企业拥有或控制的没有实物形态的可辨认非货币性资产。根据定义，满足以下条件之一的，符合无形资产的可辨认性标准：
1. 能够从企业中分离或划分出来，并能够单独或与相关合同、资产或负债一起，用于出售、转移、授予许可、租赁或交换。
2. 源自合同性权利或其他法定权利，无论这些权利是否可以从企业或其他权利和义务中转移或分离。
无形资产主要包括专利权、非专利技术、商标权、著作权、土地使用权、特许权等。这些资产具有经济价值，并且能够为企业带来利益。
需要注意的是，商誉的存在无法与企业自身分离，不具有可辨认性，因此不属于无形资产范畴。