mirna靶基因分析，mirna靶基因预测数据库

1. 界面简洁易懂

这些数据库一般是通过预测miRNA种子区与mRNA的结合情况来预测靶基因。种子区(seedregion)指的是miRNA上进化最为保守的片段，从第2个到第8个核苷酸，通常与mRNA 3’-UTR上的靶位点完全互补。

可以按基因预测miRNA，也可以按miRNA预测靶基因，只需在miRNA的搜索框里进行搜索。搜索结果里综合了两个数据库的结果，有link。

2. 对胎盘、脐带血样本和口腔样本的应用

在预测miRNA靶基因之前，可以对胎盘、脐带血样本和口腔样本进行靶向重亚硫酸盐测序，然后使用靶基因DNA甲基化测序对选定的脐带血差异甲。

3. 鉴定差异表达的免疫相关miRNA靶基因

作者将miRNA上传到多个数据库，如miRecords、miRTarbase和Tarbase，然后汇总这些数据库中所有经过验证的相互作用靶基因。通过筛选mi，鉴定差异表达的免疫相关miRNA靶基因。

4. 文库

在这里，可以根据miRNA预测结合的靶基因，也可以反过来预测结合的miRNA。选择物种后，输入miRNA名称并查看结果。Score越大，结果越可信。

5. miRWalk 2.0

miRWalk 2.0包含了多个miRNA靶基因预测数据库，如DIANA-microT, miRanda-rel, doRiNA, PITA等。提供多种数据输入方式，包括miRNA、基因、lncRNA、circRNA、小。

6. TargetScan

在预测miRNA靶基因之前，需要确定转录本的3’UTR区域。TargetScan通过3P-seq的测序技术确定转录本对应的3’UTR区，为miRNA的靶基因预测提供数据支持。

通过这些数据库，研究者可以轻松预测miRNA的靶基因，实现对基因调控的精准分析。这些工具提供了丰富的数据输入方式，方便用户根据研究需求进行操作。miRNA的研究在生物医学领域有着重要的应用前景，这些数据库的开发为miRNA靶基因分析提供了重要支持。