企业所得税一般有两种计算方式，一种是核定征收，即按企业收入的比例来计算缴纳，这种情况下，如果出现负数，则需要确认收入是否有负数，如果没有，则是计算错误，需要更改，如果企业是查账征收，则看企业的利润是证书还是负数，如果利润是正数，接下来比较实际应纳的税额和已纳税额，如果已纳税大于应纳税额，则负数是正确的，如果小于，则需要更正。