如果分公司是独立核算的纳税人，那么分公司就应当独立建账核算并向当地税务机关进行申报纳税。而分公司如果跟总公司之间是非独立核算的话，那么分公司的财务都将并入总公司统一核算管理，是否要建立有关辅助帐、明细帐，可由总公司来确定，非独立核算的分公司仅仅只是总公司的一个分支机构，相当于一个部门。