付款申请单一般用于采购付款，票到挂账，付款冲账。通常是外单位(通常指供应商)向公司要求支付货款时填写的单据，最终经领导批示同意后，会计做帐，出纳付款；费用报销单一般用于直接费用的报销，差旅费、招待费，办公用品费等。