根据《企业所得税法》及相关规定，企业注销时确实无法偿付应付款项在清算时需要计入收入征税。因此，在注销税务登记时，相关的往来账款需要清理。如果分公司注销税务登记前，账上存在大量与总公司的往来，应该通过账务处理相互抵销，没有余额。

资产全部并回总公司，总公司和分公司之间债券互相抵消，其他债权债务总公司并入总公司账中。