农产品收购发票的抵扣是一个重要的税务问题，对于纳税人来说，了解如何正确计算和抵扣进项税是非常关键的。以下是关于农产品收购发票抵扣的一些重要知识点：
1. 从小规模纳税人处获得的增值税专票，尽管增值税率是3%，但从2019年4月1日开始，以票上标明的金额×9%的扣除率计算抵扣进项税。这意味着，如果纳税人从小规模纳税人处获得了一张增值税专票，其税额为3%，那么纳税人可以按照票上标明的金额的9%来计算抵扣进项税。
2. 从农业生产者处获得的销售清单或是自行开具的农产品收购税票，以票上标明的买价×9%的扣除率计算进项税。这意味着，如果纳税人从农业生产者处获得了一张销售清单或自行开具了农产品收购税票，那么纳税人可以按照票上标明的买价的9%来计算进项税。
3. 购入的农业产品用以生产13%税率的货品的，在生产领取的当期加计1%的进项税，与具体扣除率10%相同。这意味着，如果纳税人购入了农业产品用于生产13%税率的货品，那么在生产领取的当期，纳税人可以加计1%的进项税，这与具体的扣除率10%相同。
进项税扣除是指公司在生产运营阶段中选购原料并销售产品后，需要从产值中扣除的进项税。进项税是在购买商品时产生的税收，可以用销项税额抵税。销项税额太多，需要向税务部门交税。经营者销售货品、劳务、无形资产摊销和房产的，以本期销项税额扣除本期进项税后的金额为应纳税所得额。