个人独资企业涉及的税款有：增值税，城建税，教育费附加，地方教育费附加，个人所得税（工资薪金，生产经营），印花税等。

个人独资企业需要缴纳生产经营个人所得税，年度结束之后，需要做生产经营个人所得税年度申报的。