物业公司收水费可以按差额简易办法计税，根据国家税务总局公告2016年第54号公告，公告规定：提供物业管理服务的纳税人，向服务接受方收取的自来水水费，以扣除其对外支付的自来水水费后的余额为销售额，按照简易计税方法依3%的征收率计算缴纳增值税。