在财务核算方面，分店的运作模式直接影响其财务管理方式。当分店不实行独立核算时，它实质上是总公司的一个组成部分，所有财务活动需纳入总公司的统一管理之下。这种情况下，是否设置辅助账目或明细账，完全由总公司决定。而一旦分店采取独立核算的方式，它便成为独立的纳税实体，需要自行建立账簿进行财务记录，并定期向地方税务机关提交纳税申报。这样的安排确保了分店财务活动的独立性和透明度，同时也符合税务合规的要求。