根据国税函[2009]772号文的规定，企业在计算以后年度多缴的企业所得税税款时，应遵循弥补亏损的原则。假设某企业2007年亏损100万元，并在2009年度追补审批资产损失300万元后，形成新的亏损400万元。新增的亏损额为300万元，需要在未来五年内进行弥补。如果该企业在2008年度实际利润为200万元，并已弥补了2007年的100万元亏损，那么按照国税函[2009]772号文的规定，2008年度应追补弥补亏损100万元。

在这种情况下，该企业2008年度实际缴纳的所得税为25万元（基于100万元的亏损乘以25%的税率）。由于追补弥补亏损，2008年度应追补弥补亏损100万元，导致实际缴纳所得税款为0。因此，2008年度多缴的25万元税款应在2009年度抵缴。

在2009年度，该企业首先需要继续弥补2007年度的亏损100万元。然后，计算出2009年度应纳税款后，再用于抵缴2008年度的多缴税款。值得注意的是，超过五年未弥补的亏损将不能在税前扣除。