在纳税人进行注销时，其加计抵减额的结余部分无需特别处理。

根据《财政部 税务总局 海关总署关于深化增值税改革有关政策的公告》（财政部 税务总局 海关总署公告2019年第39号）第七条第（六）项的规定，当加计抵减政策执行期满后，纳税人将不再计提新的加计抵减额，同时已存在的加计抵减额余额也停止继续抵减。若纳税人在加计抵减政策到期前选择注销，那么他们所持有的加计抵减额余额同样适用上述规定，无需进行额外的处理措施。值得注意的是，这里提到的加计抵减额余额既包括正数也包括负数。