公司发放给员工的机票，作为一项集体福利措施，其相关的进项税额不能从销项税额中进行抵扣。

根据《营业税改征增值税试点实施办法》（财税〔2016〕36号印发）第二十七条第（一）项的规定，纳税人在购买货物、加工修理修配劳务、服务、无形资产和不动产时，若这些项目被用于集体福利或个人消费，则相应的进项税额不可从销项税额中扣除。