分公司独立建账核算的依据如下：

根据《中华人民共和国增值税暂行条例》第二十二条的规定，固定业户应当向其机构所在地的主管税务机关申报纳税。总机构和分支机构不在同一县市的，应当分别向各自所在地的主管税务机关申报纳税；经国务院财政、税务主管部门或者其授权的财政、税务机关批准，可以由总机构汇总向总机构所在地的主管税务机关申报纳税。

因此，如果分公司在当地办理了营业执行，那么它就是一个独立的增值税纳税人，应该单独申报缴纳增值税。但如果经过特别批准，例如经国务院财政、税务主管部门或者其授权的财政、税务机关批准，且未办理税务登记的情况下，则由总机构汇总缴纳增值税。

总的来说，分公司在当地办理了营业执行后，可以进行独立申报增值税。