公司年会费用应计入管理费用中的福利费用科目。

管理费用涵盖了企业行政管理部门为组织和管理生产经营活动所发生的所有相关费用。具体包括：企业在经营管理过程中，由董事会和行政管理部门产生的费用，以及应由企业统一承担的费用，如公司经费、工会经费、待业保险费、劳动保险费、董事会费、聘请中介机构费、咨询费、诉讼费、业务招待费、办公费、差旅费、邮电费、绿化费、管理人员工资及福利费等。

公司年会作为员工的集体活动，其费用应当按照福利费用进行账务处理。