自建房屋在会计处理中，可以作为固定资产进行入账。其入账费用包括建造费、装修费等与厂房建造相关的所有费用，这些都可以计入固定资产的成本中。

然而，如果自建房屋没有发票，那么由此产生的折旧费用将无法在税前扣除。因此，为了确保税务合规，应尽量获取相关发票并进行入账处理。