小规模纳税人增值税申报流程：

1. 打开电子申报系统，并选择申报与缴纳功能。在系统中寻找到小规模增值税报表的选项。

2. 进入该报表后，系统将提示您填写不含税的收入数据。请根据不同的税率，正确无误地填写相应的不含税收入，并在确认无误后点击确定。

3. 接下来，进入主表部分。如果季度不含税销售额不超过三十万，直接填写主表的第十行；如果是个体户，则填写第十一行。如果有代开的增值税专票，需要将其信息填入主表前三行的相应栏次中。若季度不含税销售额超过三十万，则按前三栏的相应内容进行填写。

4. 完成上述步骤后，检查税额是否正确。如果存在1%的税费减免情况，则需要填写减免明细表，并将减征的2%税额填写进去，以达到减税的目的。

5. 对于免税销售额的情况，可以直接填写第十二行。

6. 当所有信息都填写完毕后，确保没有错误再保存。

7. 最后，在申报功能下点击申报按钮。当申报状态显示为“申报成功”时，就可以继续进行缴费等后续操作了。