小规模纳税人与一般纳税人在申报纳税上的主要差异体现在增值税应纳税额的计算方式上。

对于小规模纳税人而言，其增值税应纳税额是通过将不含增值税的收入乘以一个固定的征收率来计算得出的。

相比之下，一般纳税人则需要根据销项税额、进项税额以及上期留抵税额之间的差额来确定其增值税应纳税额。