工会经费的计提基础是综合了年终奖金在内的。

工会经费是指工会依法获取并用于正常活动的费用。根据《中华人民共和国工会法》，工会经费的主要来源包括工会会员缴纳的会费和按每月全部职工工资总额的2%向工会拨交的经费这两项，其中2%工会经费是最主要的资金来源。

这里所指的工资总额，是将员工的年终奖一并纳入计算基数进行计提的。