支票存根，作为自制的原始单据，其填写过程中若出现错误，允许进行更正，但必须遵循严格的会计规范。具体来说，应采用红线更正法来修正错误：首先，使用红笔在错误部分划上横线，随后在该线上加盖更正人的私章。这一过程不仅是对错误的纠正，更是维护会计核算严肃性的必要步骤。