在申报小规模纳税人减免教育费附加时，纳税人需根据实际情况，在申报表中勾选是否享受增值税小规模纳税人减征政策选项。系统将自动计算减征金额，纳税人确认即可。根据《财政部税务总局关于实施小微企业普惠性税收减免政策的通知》（财税（〔2019〕13号）第三条，由省、自治区、直辖市人民政府根据本地区实际情况和宏观调控需要确定，对增值税小规模纳税人可以在50%的税额幅度内减征教育费附加、地方教育附加。