首先，纳税人需要从官方网站下载“自然人税收管理系统扣缴客户端”软件，并完成安装与启动。

接着，登录到扣缴客户端中，选择进入生产经营申报通道。当单位类型为个体工商户、个人独资企业或合伙企业时，系统会自动显示该通道，此时应点击“生产经营”。

然后，点击“预缴纳税申报”，系统将自动获取企业的核定信息，并引导至申报主界面。

需要注意的是，如果系统未能成功获取企业核定信息，可以通过点击“单位信息”→“征收方式”/“投资者信息”→“更新”，来手动下载最新的核定信息。下载完成后，再次尝试点击“预缴纳税申报”以进入填写申报表的主界面。

接下来，按照系统提示逐步填写申报表的各项信息。在确认所有数据无误后，点击“保存”。若系统检测到“投资者减除费用”、“专项扣除”或“依法确定的其他扣除”中有任意一项非零值，则会弹出提示框询问是否继续申报。根据具体情况，可以选择直接保存报表（点击“是”），或者修改相应数据后重新提交（点击“否”）。

之后，点击“网上报税”→“网上申报”，进入申报表报送页面。在这里，系统会列出所有已保存但尚未报送的报表。选定相关纳税人后，点击“发送申报”按钮完成报送过程。

最后一步是进行税款缴纳操作。