运输公司根据实际收到的运输费用开具发票。

当运输服务完成后，收入确认的会计处理如下：

借：应收账款等科目

贷：主营业务收入

应交税费—应交增值税（销项税额）

随后，对于运输服务的成本结转，会计分录为：

借：主营业务成本

贷：劳务成本

银行存款等科目