在填写增值税纳税申报表及其附列资料时，必须严格遵循相关规定。当应税销售额（包括劳务或服务）大于销项负数时，应填列扣除负数后的数据；若应税销售额小于销项负数，则需用销项负数减去本期销售额，并以负数形式填列。

然而，如果负数发票的金额大于正数发票，直接通过电子系统进行申报将无法完成，此时需要前往税务机关进行手工申报。