在实际操作中较为罕见，税务机关有权进行核定征收的情况包括以下几种：
1. 按照相关法律法规的规定，企业可以不设置账簿。 2. 尽管法律法规要求设置账簿，但企业未按要求执行。 3. 企业擅自销毁账簿或拒绝提供必要的纳税资料。 4. 虽然设有账簿，但由于账目科目混乱、成本资料、收入凭证和费用凭证残缺不全，导致难以进行查账。 5. 企业在发生纳税义务时未按照规定的期限办理纳税申报，并且在税务机关责令限期申报后逾期仍未申报。 6. 申报的计税依据明显偏低且无正当理由。
在核定征收的情况下，企业可以根据税务核定的项目开具发票。