企业在采购农产品时，并非直接从生产者手中购入。其进项税额的抵扣情况需视中间商的具体情形而定。若企业为一般纳税人，且中间商提供了增值税专用发票，那么这部分税额是可以用于抵扣的。反之，如果企业不属于一般纳税人，或者中间商未能开具专用发票，则无法进行抵扣。