当公司员工因出差或其他事务需要报销住宿费时，会计处理应遵循企业实际承担的金额进行入账。若员工报销的金额超出公司设定的标准，会计只需根据经审批的实际金额进行记录。对于超出标准但未支付的部分，不应计入公司账面，或者按照发票金额进行入账。而对于企业实际上未承担的部分，应在企业汇算清缴时进行调整。