在处理公司支出时，若缺少发票，企业应先依据实际支付的金额进行账务处理。例如，当公司购置固定资产而未取得发票时，应执行以下会计操作：
1. 借记固定资产账户； 2. 贷记银行存款等相应账户。
在进行年度财务结算和缴纳所得税的过程中，对于未能提供发票的支出项目，需将其计入利润总额，并据此计算应缴所得税。此外，由于固定资产未获得正式发票，其折旧费用将无法在税前扣除。