填写增值税申报表时，首先需要根据增值税开票系统发票开具汇总表、未开票收入等填写附表二。接着，根据在增值税综合服务平台勾选的进项税额以及进项税额转出等信息填写附表二。如果有减免税项目，则需要填写减免税明细表和附表四。同时，如果存在扣除项目，则需填写附表三。最后，所有数据将自动带入主表进行申报。

为了确保准确无误地完成申报，建议纳税人可以在国家税务总局下载《增值税纳税申报表（一般纳税人适用）》及其附列资料填写说明。