企业在计算应纳税所得额时，允许扣除的项目包括企业实际发生的与取得收入相关的合理支出。这些支出涵盖成本、费用、税金、损失以及其他相关支出。

根据《中华人民共和国企业所得税法》第八条的规定，企业实际发生的与取得收入相关的合理支出，如成本、费用、税金、损失和其他支出，可以在计算应纳税所得额时予以扣除。