企业出口核销流程主要包括以下三个步骤：
1. 在海关注册的软件中申请核销单。 2. 向外管局申领正本核销单，即在外管局进行备案。 3. 货物出口后，等待海关退回核销单、报关单核销联，并附上退税核销联发票和收汇水单，然后到外管局进行核销。