在处理科目错误但金额正确的记账凭证时，首先需要采用红字填写一张新的记账凭证，用以冲销原先错误的凭证。随后，再使用蓝字编制一张准确的记账凭证来替换之前的误操作。如果实际记录的金额小于应有的金额，则需按照两者之间的差额，用蓝字填写另一张记账凭证以作调整。反之，若实际金额超出了应计金额，则应根据超出部分的差额，用红字填制相应的记账凭证进行更正。