承包承租经营个人所得税的计算方式是：应纳税所得额乘以税率减去速算扣除数。其中，应纳税所得额等于利润总额加上纳税调增金额再减去纳税调减金额。适用的税率范围为5%到35%，采用五级超额累进税率。在季度末，根据当季的利润情况来进行申报和缴纳税款。