对于一般纳税人而言，当企业购入往复式压缩机并取得增值税专用发票时，进项税额是可以进行认证抵扣的。

具体来说，一般纳税人在处理购入往复式压缩机的账务时，应遵循以下步骤：

首先，记录固定资产的增加，

其次，确认应交税费中应交增值税（进项税额）的减少，

最后，根据实际支付情况，贷记银行存款等相关科目。