根据《中共中央组织部、财政部、国家税务总局关于非公有制企业党组织工作经费问题的通知》（组通字[2014]42号）的规定，非公有制企业的党组织工作经费被纳入管理费用中进行列支。这些经费的扣除额度被限制在职工年度工资薪金总额的1%以内，并且需要据实扣除。