防伪税控系统的维护费用是允许抵扣的。

根据《财政部 国家税务总局关于增值税税控系统专用设备和技术维护费用抵减增值税税额有关政策的通知》（财税〔2012〕15号）的规定，为了减轻纳税人的经济压力，经国务院批准，自2011年12月1日起，增值税纳税人购买增值税税控系统专用设备所支付的费用以及缴纳的技术维护费可以在增值税应纳税额中全额抵减。