当企业发现库存现金短缺时，应进行相应的会计分录。首先，记录待处理财产损溢的借方和库存现金的贷方。

具体分录如下：

借：待处理财产损溢-待处理流动资产损溢

贷：库存现金

一旦批准处理后，需要将责任方或保险公司赔偿的部分记入其他应收款，同时将无法查明原因的部分记入管理费用。

分录如下：

借：其他应收款-应收现金短缺款(××个人)或应收保险赔款(应由责任人赔偿或保险公司赔偿的部分)

借：管理费用(无法查明的其他原因)

贷：待处理财产损溢-待处理流动资产损溢