所得税减免部分的会计分录有两种操作方式。一种是直接按减免后实际应纳税额进行计提和支付，不用做减免的部分的分录。另外一种是按减免之前的金额进行计提，然后在支付的时候将减免的部分计入到营业外收入—税收减免科目。
分录为： 借：所得税费用 贷：应交税费—应交企业所得税
实际缴纳的时候： 借：应交税费—应交企业所得税 贷：银行存款
营业外收入—税收减免
这两种操作方式各有优缺点。第一种方式简单明了，但可能会忽略掉一些减免的金额；第二种方式虽然复杂一些，但能够更精确地反映企业的税收情况。因此，企业在选择操作方式时需要根据自身的实际情况进行考虑。