企业支付的化粪池费用，在会计核算中有多种处理方式。首先，根据具体情况，可以将这部分费用计入到固定资产或者长期待摊费用等科目进行核算。具体来说，如果是新建或改建项目，可以将化粪池费用计入到固定资产科目；如果是长期使用且无法直接计入到某一特定期间的费用，可以将其计入到长期待摊费用科目。
在实际使用期间，化粪池的费用需要分摊转入到管理费用科目。这是因为化粪池是企业日常运营过程中不可或缺的设施，其维护和管理费用应该计入到企业的管理费用中。分摊的方法可以根据化粪池的使用情况和费用金额来确定，例如按照使用年限或者费用金额的比例进行分摊。
另外，如果企业是一般纳税人并且取得了专用发票，还应该确认对应的进项税额。这是因为增值税是一种流转税，企业在购买商品或接受服务时支付的增值税可以在后续销售过程中抵扣。因此，企业在支付化粪池费用时取得的专用发票上的增值税金额应该确认为进项税额，并在后续销售过程中进行抵扣。
综上所述，企业支付的化粪池费用的会计核算可以分为以下几个步骤：首先，根据具体情况将费用计入到固定资产或者长期待摊费用等科目；其次，在实际使用期间将费用分摊转入到管理费用科目；最后，如果企业是一般纳税人并且取得了专用发票，还应该确认对应的进项税额。具体的会计分录如下：借：固定资产—化粪池，长期待摊费用—化粪池，应交税费—应交增值税—进项税额，贷：应付账款等。