企业在销售商品时，如果发出的商品损坏需要进行赔偿，其账务处理涉及到“主营业务收入”、“主营业务成本”和“营业外支出”三个科目。
首先，当企业销售商品时，应借记“银行存款”，贷记“主营业务收入”和“应交税费—应交增值税（销项税额）”。这一步操作主要是记录销售收入的实现以及增值税的计提。
其次，结转主营业务成本时，应借记“主营业务成本”，贷记“库存商品”。这一步操作主要是将销售商品的成本从库存中扣除，反映在主营业务成本中。
最后，当发出商品损坏需要赔偿时，应借记“营业外支出”，贷记“银行存款”。这一步操作主要是记录因商品损坏而产生的非经常性损失。
总的来说，企业在销售商品过程中，如果发生商品损坏需要进行赔偿的情况，需要通过上述三个科目进行账务处理，以确保账务的准确性。