当增值税专用发票丢失时，企业需要进行一系列的操作来处理这个问题。首先，企业需要做发票丢失备案，然后将发票复印件与丢失备案表格一起作为附件入账核算。
在单位取得发票复印件与丢失备案表格入账的时候，账务处理是按照以下步骤进行的：
1. 借：库存商品或原材料。这一步是为了记录企业购买的库存商品或原材料的成本。
2. 应交税费—应交增值税（进项税额）。这一步是为了记录企业应该支付的增值税金额。
3. 贷：应付账款等科目。这一步是为了记录企业应该支付给供应商的应付账款。
通过以上步骤，企业可以正确地处理增值税专用发票丢失的问题，并确保账务处理的准确性。